Pour s'approprier les enjeux de conservation de la biodiversité et de developpement durable, la France a choisi de développer la voix de la concertation avec l'ensemble des acteurs du territoire : citoyens, élus, agriculteurs, forestiers, propriétaires terriens, associations, usagers et experts sont associés à la gestion de chaque site, via le Comité de pilotage.
Ce Comité de pilotage réunit l’ensemble des acteurs et usagers du site, à chaque étape de la vie du site :
1. élaboration du Document d’objectifs,
2. animation du site et planification des actions.
Ses réunions régulières sont l’occasion pour chacun de mieux comprendre les enjeux écologiques et socio-économiques du site, de partager des objectifs de gestion communs et d’échanger autour des actions à mettre en œuvre.
Le président du Comité de pilotage est élu tous les 3 ans par les représentants des collectivités territoriales concernées par le site Natura 2000.